1、奧密克戎怎么就火了呢?
WHO將最新的B.1.1.529新冠病毒變種命名為Omicron(奧密克戎),并列為5種“密切關(guān)注變種”之一 。
11月24日,南非衛(wèi)生部門(mén)首次向世界衛(wèi)生組織(WHO)報(bào)告發(fā)現(xiàn)的新冠病毒變種B.1.1.529,并引起了社會(huì)極大的關(guān)注 。實(shí)際上,B.1.1.529變種首先是在11月9日在南非鄰國(guó)的博茨瓦納共和國(guó)發(fā)現(xiàn)的,并迅速在南非擴(kuò)散,11月以來(lái),B.1.1.529變種在南非流行比率已經(jīng)上升至75%,幾乎取代了正在全球流行中占主導(dǎo)地位的德?tīng)査兎N 。這一現(xiàn)象即刻引起WHO關(guān)注,加上B.1.1.529變種的病毒S蛋白含有目前發(fā)現(xiàn)最多的突變位點(diǎn)(32-35個(gè)突變位點(diǎn)),WHO于2021年11月26日將其列為第5種“密切關(guān)注突變體”(VOC),以希臘字母命名法命名為Omicron(奧密克戎)變種,與已經(jīng)存在的前4種主要變種:英國(guó)發(fā)現(xiàn)的Alpha(B.1.1.7);南非發(fā)現(xiàn)的Beta (B.1.351);巴西發(fā)現(xiàn)的Gamma (P.1);以及印度發(fā)現(xiàn)的Delta (B.1.617.2)列為相同關(guān)注等級(jí) 。截止到目前,Omicron已在中國(guó)香港、英國(guó)、德國(guó)、意大利、比利時(shí)、以色列等多個(gè)國(guó)家和地區(qū)檢出 。全球多國(guó)由于該新突變株的出現(xiàn)收緊了防控措施 。

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圖1:WHO組織定義的5種密切關(guān)注的新冠病毒突變株(VOC) 。
2、奧密克戎的全球流行走向仍然未知
目前為止,共有5種變種被列為“密切關(guān)注突變體”VOC, 分別是Alpha,Beta,Gamma, Delta和最新的Omicron 。其中Alpha在2020年10月到2021年6月作為主要毒株在全球流行,隨后,Delta逐漸代替Alpha成為優(yōu)勢(shì)毒株 。在Alpha和Delta的焦灼激戰(zhàn)過(guò)程中,在南非出現(xiàn)的Beta和巴西出現(xiàn)Gamma由于顯著的免疫逃逸能力,也被列為VOC,但Beta和Gamma在全球范圍內(nèi)的流行數(shù)目遠(yuǎn)小于Alpha和Delta 。在南非報(bào)道Omicron病例的兩天后,Omicron的全球流行數(shù)目還未知的情況下,11月26日WHO即將Omicron列為VOC,可見(jiàn)其對(duì)Omicron在南非傳播比例迅速上升勢(shì)頭的高度重視 。
3、奧密克戎的突變最多,突變都在哪里,可能有什么影響呢?
新冠S蛋白(刺突蛋白)是負(fù)責(zé)病毒入侵宿主細(xì)胞的蛋白,S蛋白通過(guò)與細(xì)胞上的受體ACE2結(jié)合進(jìn)入細(xì)胞 。現(xiàn)有疫苗的主要成分也是S蛋白,通過(guò)誘導(dǎo)針對(duì)S蛋白的抗體來(lái)阻止病毒進(jìn)入細(xì)胞 。因此,S蛋白上的突變直接影響了病毒進(jìn)入細(xì)胞的效率以及疫苗誘導(dǎo)的抗體能否有效阻止病毒 。
S蛋白在結(jié)構(gòu)上分為兩部分,S1區(qū)和S2區(qū) 。S1又分為4個(gè)小的結(jié)構(gòu)域:N端結(jié)構(gòu)域(NTD),受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域(RBD), 以及亞結(jié)構(gòu)域1和2(SD1,SD2) 。其中RBD負(fù)責(zé)與受體ACE2結(jié)合,而NTD負(fù)責(zé)在RBD結(jié)合受體時(shí)起穩(wěn)定作用 。S2區(qū)主要包括7肽重復(fù)序列1和2(HR1, HR2), 這兩個(gè)結(jié)構(gòu)域負(fù)責(zé)受體結(jié)合后拉近病毒膜與細(xì)胞膜的距離,促進(jìn)膜融合以完成入侵過(guò)程 。
目前公布的突變體序列表明奧密克戎在S蛋白上有33個(gè)左右的點(diǎn)突變,其中S1上有27個(gè)突變(NTD 7個(gè),RBD 15個(gè),SD1和SD2 上共5個(gè)),還有6個(gè)突變發(fā)生在S2結(jié)構(gòu)域上(圖2) 。由于15個(gè)突變集中在RBD區(qū),因此有懷疑如此大量的突變會(huì)使得新冠病毒“脫胎換骨”,可能會(huì)突破現(xiàn)有的疫苗防線 。
但實(shí)際情況是,其中大部分突變并不是憑空出現(xiàn)的,在已經(jīng)存在的突變株中出現(xiàn)過(guò) 。這33個(gè)突變都在以前的毒株中以單點(diǎn)突變的形式出現(xiàn)過(guò),其中8個(gè)突變?cè)赩OC株里出現(xiàn)過(guò),如del69-70,del144曾出現(xiàn)在Alpha中,K417N, N501Y曾出現(xiàn)在Beta和Gamma中,T478K曾出現(xiàn)在Delta中,而484位的突變也持續(xù)出現(xiàn)在Beta, Gamma, Eta, Kappa等突變株中 。

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