1、分布不同：云杉產(chǎn)于陜西西南部（鳳縣）、甘肅東部（兩當(dāng)）及白龍江流域等地，稍耐蔭；水杉分布于湖北、重慶、湖南三省交界的利川、石柱、龍山三縣的局部地區(qū)，垂直分布一般為海拔750~1500米 。
2、形態(tài)特征不同：云杉子葉6-7枚，條狀錐形，長(zhǎng)1.4-2厘米，初生葉四棱狀條形，長(zhǎng)0.5-1.2厘米，先端尖，四面有氣孔線，全緣或隆起的中脈上部有齒毛；水杉葉條形 ， 長(zhǎng)0.8-3.5（常1.3-2）厘米 ， 寬1-2.5（常1.5-2）毫米，上面淡綠色，下面色較淡 ， 沿中脈有兩條較邊帶稍寬的淡黃色氣孔帶，每帶有4-8條氣孔線，葉在側(cè)生小枝上列成二列，羽狀 。
3、生長(zhǎng)環(huán)境不同：云杉耐陰、耐寒、喜歡涼爽濕潤(rùn)的氣候和肥沃深厚、排水良好的微酸性沙質(zhì)土壤，生長(zhǎng)緩慢，屬淺根性樹(shù)種 。海拔2400-3600米地帶，常與紫果云杉、岷江冷杉、紫果冷杉混生，或成純林；水杉多生于山谷或山麓附近地勢(shì)平緩、土層深厚、濕潤(rùn)或稍有積水的地方，耐寒性強(qiáng)，耐水濕能力強(qiáng)，在輕鹽堿地可以生長(zhǎng)為喜光性樹(shù)種，根系發(fā)達(dá)，生長(zhǎng)的快慢常受土壤水分的支配，在長(zhǎng)期積水排水不良的地方生長(zhǎng)緩慢，樹(shù)干基部通常膨大和有縱棱 。
4、用途不同：云杉樹(shù)干高大通直，節(jié)少，材質(zhì)略輕柔 ， 紋理直、均勻，結(jié)構(gòu)細(xì)致，易加工，具有良好的共鳴性能 。可供建筑、飛機(jī)、樂(lè)器（鋼琴、提琴）、舟車、家具、器具、箱盒、刨制膠合板與薄木以及木纖維工業(yè)原料等用材；水杉材質(zhì)輕軟 ， 可供建筑、板料、造紙等用；樹(shù)姿優(yōu)美，為庭園觀賞樹(shù) 。
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