從中醫(yī)發(fā)展史上看，我國歷代醫(yī)家對都很重視 。不僅在著作中有對氣功的論述，而且許多名醫(yī)本人也是氣功實踐家 。如漢代名醫(yī)張仲景在其名著《金匱要略》一書中說四肢才覺重滯，即導(dǎo)引吐吶，膏摩，勿令九竅閉塞 。
這里所說的導(dǎo)引吐吶就是氣功的一種方法 。著名的五禽戲，相傳就是漢代名醫(yī)華佗所創(chuàng)，流傳到今天仍被氣功愛好者所喜愛 。
其后晉代葛洪所著《抱樸子》、南北朝陶弘景所著《養(yǎng)性延命錄》、隋代巢元方所著的《諸病源候論》、唐代孫思邈所著《備急千金要方》、王燾所著《外臺秘要》、宋代《圣濟總錄》以及金元四大家的著作中都有氣功方面的論述 。
在明代著名醫(yī)學家李時珍所著《奇經(jīng)八脈考》中指出內(nèi)景隧道，惟返觀者能照察之 。意思是說，在練某種靜功的過程中能夠覺察出人體的經(jīng)絡(luò)變化 。清代著名溫病學家葉天士和吳鞠通，都有氣功的實踐和論述 。
近代名醫(yī)張錫純所著《醫(yī)學衷中參西錄》中也有專論氣功的章節(jié)，并指出學醫(yī)者應(yīng)參以靜坐 。從以上提及的名醫(yī)和論著與氣功的關(guān)系，即可知氣功養(yǎng)生學歷史之悠久，又可見氣功在中醫(yī)學中的重要地位 。
氣功作為中醫(yī)學的一個分支，在理論上主要以中醫(yī)理論為基礎(chǔ)，在創(chuàng)編功法和氣功鍛煉中也應(yīng)用陰陽、五行、臟腑、經(jīng)絡(luò)、精氣神等學說作指導(dǎo);對氣功鍛煉產(chǎn)生的效應(yīng)及氣功作用機制等認識，到目前為止，也主要以中醫(yī)理論來闡述 。
當然，由于自古以來，氣功實踐不只為醫(yī)家獨有，儒、道、佛、武等各家在各自不同的實踐中，分別對氣功形成了自己的認識，也構(gòu)成了氣功理論的一部分 。
氣功實踐的結(jié)果也為中醫(yī)學提供了新的內(nèi)容
如明代醫(yī)學家李時珍、張景岳等分別對奇經(jīng)八脈和丹田命門理論的系統(tǒng)闡發(fā)，在很大程度上是建立在氣功實踐的基礎(chǔ)上的 。氣功強調(diào)對意念的運用，是對中醫(yī)調(diào)神理論和情志學說的補充和發(fā)展 。
掌握了氣功心身同練的特點，有助于深入理解中醫(yī)形神合一、天人合一的整體觀，而氣功作用機制的探討，亦有益于對中醫(yī)氣化論、精氣神理論和臟腑心理相關(guān)性等的深入認識 。發(fā)掘整理氣功與藥物配合應(yīng)用，氣功針灸、氣功按摩等傳統(tǒng)治療方法也可提高臨床療效、開拓新的治療途徑 。
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